Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COG7P83436 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG7P83436 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG7P83436 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG7P83436 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG7P83436 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG7P83436 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG7P83436 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG7P83436 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG7P83436 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG7P83436 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms