Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms