Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms