Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX1P48742 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX1P48742 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX1P48742 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX1P48742 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms