Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP2P42575 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP2P42575 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms