Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA3P42263 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA3P42263 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms