Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms