Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms