Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD12P35452 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms