Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms