Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms