Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms