Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPRBP23467 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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