Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HOXA5P20719 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms