Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CTLA4P16410 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CTLA4P16410 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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