Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms