Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PEPDP12955 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PEPDP12955 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PEPDP12955 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PEPDP12955 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PEPDP12955 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PEPDP12955 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PEPDP12955 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms