Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP1-4P0C5Y4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms