Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA4P06727 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms