Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms