Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POP4O95707 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POP4O95707 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POP4O95707 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POP4O95707 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POP4O95707 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POP4O95707 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms