Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB6O95452 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB6O95452 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB6O95452 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB6O95452 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB6O95452 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB6O95452 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB6O95452 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB6O95452 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms