Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAPGEF3O95398 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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