Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLR5O60602 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLR5O60602 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLR5O60602 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms