Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms