Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA8JA6NMD2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA8JA6NMD2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms