Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms