Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms