Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PACSIN2Q9UNF0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PACSIN2Q9UNF0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms