Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms