Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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