Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKS1Q9NXB0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms