Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms