Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF275Q9NSD4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms