Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms