Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL25A1Q9BXS0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms