Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms