Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NICN1Q9BSH3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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