Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms