Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF3RQ99062 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF3RQ99062 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF3RQ99062 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSF3RQ99062 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms