Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPTM1LQ96KA5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms