Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms