Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms