Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms