Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms