Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HGDQ93099 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HGDQ93099 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HGDQ93099 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HGDQ93099 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HGDQ93099 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HGDQ93099 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HGDQ93099 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HGDQ93099 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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