Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ZCCHC13Q8WW36 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms