Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRN4Q8WUT4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms