Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF248Q8NDW4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF248Q8NDW4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF248Q8NDW4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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