Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM48Q8IWZ4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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